Genome-wide search for segregation distortion loci associated with the expression of complex traits in Populus tomentosa

Segregation distortion of molecular markers has been reported in a broad range of organisms. It has been detected in an interspecific BC1 Populus pedigree established by controlled crossing between clone “LM50” (Populus tomentosa) and its hybrid clone “TB01” (P. tomentosa×P. bolleana). The study with a total of 150 AFLP markers (approximately 18.9% of the total loci) exhibited significant deviation from the Mendelian ratio (1:1) (p<0.01). Twenty-five percent of the markers were mapped on the pa-rental specific genetic linkage maps of clones “LM50” and “TB01” with a pseudo-test-cross mapping strategy. Twelve linkage groups had markers with skewed segregation ratios, but the major regions were on linkage groups TLG2, TLG4 and TLG6 in the linkage map of clone “LM50”. We also analyzed the association between distorted loci and expression of complex traits with Map-maker/QTL software. A total of 16 putative QTLs affecting 12 traits were identified in the distorted regions on seven linkage groups. Therefore we could detect the distribution of skewed loci along the entire genome and identify the association between quantitative traits and segregation loci via genetic mapping in an interspecific BC1 P. tomentosa family. Furthermore, the genetic nature and pos-sible causes of these segregation distortions for differentiation between female and male parents were also discussed.     

糯玉米栽培技术

糯玉米是普通玉米发生基因突变而形成的一个特殊玉米变异类型。营养丰富，具有较好的适口性，较高的粘滞性和消化率。加温处理后具有较高的膨胀力和透明性，用途非常广泛．果穗可作鲜食、罐藏加工。籽粒可加工成糯玉米粉、作饲料和工业原料．随着人们生活水平的提高和膳食结构的变化及种植业结构的调整，名、优、特、新农作物越来越受到广大农民朋友和消费者的欢迎。以鲜食糯玉米为例，每亩采收3500穗左右，     

微卫星DNA标记在家兔遗传育种中的应用

微卫星DNA是一类由1～6个核苷酸为重复单元而形成的串联重复序列,由于它具有含量丰富、多态性高、共显性等优点.而广泛应用于鉴定亲缘关系、构建遗传图谱、数量性状位点(QTL)定位、遗传多样性估计、标记辅助选择等方面.本文就微卫星标记在家兔遗传育种中的应用进行概述.     

用籼/籼交重组自交系群体构建的分子遗传图谱及其与籼/粳交群体的分子图谱的比较

为了最终实现对籼稻数量性状基因位点 (QTLs)精确定位 ,用一个包含 1 31个系的籼 /籼交重组自交系群体 (F6∶7)构建了分子遗传连锁图谱。该图谱含由 1 1 3个水稻探针、2 8个小麦探针揭示的 1 6 0个RFLP标记和由 5个PstⅠ /MseⅠ引物组合揭示的 78个AFLP标记。群体的杂合性比率接近期望值 ,表明该群体具有正常的遗传结构。在 6个染色体区域观察到标记的偏分离 ,表明即使在亚种内群体中也可能发生标记的偏分离。本图谱的总长度为 1 4 35 8cM ,相邻标记间的平均距离为 6 38cM。由于采用了一套日本水稻基因组计划 (RGP)的RFLP标记 ,使本图谱能与RGP图谱进行比较。结果表明 ,两个图谱上的共同标记所覆盖图谱总长度几乎相同 ;在水稻 1 2条染色体中的 9条表现完全的连锁保守性。此外 ,水稻的第 1号染色体与小麦的第 3组染色体具有很强共线性。但是 ,两个图谱间也存在明显的差异 ,在 1S、1L、4L和 8L 4个染色体臂上发现 4个小倒位 ;除第 5号和第 6号染色体外的其他染色体上共检测到 1 9个新的位点。籼稻亲本间在染色体臂 2S、7S、1 0L和 1 1S 4个区域的RFLP多态性很低或没有 ,从而导致籼稻图谱在这些区域呈现空白。在这个籼稻图谱中 ,未检测到第 1 1号和 1 2号染色体间的重复性。还就稻属在基因组进化中的染     

猪的PGD MOS HXB基因位点的PCR—SSCP分析

PCR－SSCPS即聚合酶链一单链构型多态性（PCR－SingleStrandC0nformatlonPolmporph；sins，SSCPS），它是通过DNA单链内部构型的变化来检测DNA序列变化的，所检测的突变点不仅仅限于酶切位点，检测的灵敏度也较高，并且不需任何特殊仪器，因而应用前景较为广阔。本文所研究的三     

牛消化道Ⅰ型肽载体克隆测序及编码蛋白结构分析

从牛瓣胃上皮提取RNA,根据已知的人、鼠、兔、羊PepT1序列设计引物,PCR扩增目的片段cDNA,扩增产物经纯化、克隆后测序.克隆测序片段为1566 bp(DQ309694),与其它动物已知PepT1序列比对,发现该片段位于第3～10跨膜结构域之间.牛测定序列与人、鼠、兔、羊、狗、鸡和猪PepT1相应片段核苷酸序列同源性分别为82.89%、80.14%、78.93%、96.04%、83.08%、63.90%和85.66%,相应片段氨基酸序列同源性分别为81.45%,79.62%、76.25%、94.06%、81.49%、61.41%和83.56%.对8种动物(牛、人、鼠、兔、羊、狗、鸡、猪)测序片段内氨基酸序列同源性分析表明,PepT1是高度保守的蛋白,其中跨膜结构域的氨基酸序列保守性高于膜外环.8种动物PepTl测序片段内各跨膜结构域的氨基酸序列同源性均在90%以上,第3、4、 5 6、7,8,9和10跨膜结构域的氨基酸序列同源性分别为90.97%、91.07%、97.62%、93.45%、94.05%、91.67%、91.45%和95.83%.8种动物测序片段内膜外环的氨基酸序列同源性在70%～99%之间,以第4-5跨膜结构域之间膜外环的同源性最高,9-10跨膜结构域之间膜外环的同源性最低,3-4、4-5、5-6,6-7、7-8、8-9、9-10跨膜结构域之间膜外环的氨基酸序列同源性分别为77.63%、98.86%、86.72%、90.13%、91.25%、88.33%和71.74%.9-10结构域之间是1个位于细胞外的大膜外环,可能对底物的识别有重要作用,牛在此区域与鸡相同区域的氨基酸序列同源性仅为29.3%,与大鼠,狗、人、兔、猪和羊相应序列的同源性依次为65.17%、71.64%、67.16%、60.20%、73.13%和88.56%.对测序BPepT1片段编码蛋白的糖基化和磷酸化位点分析表明,测序片段编码蛋白共有6个N-糖基化位点和3个蛋白激酶C依赖性(PKC)磷酸化位点.     

大白菜叶片长宽性状的QTL定位

利用一套大白菜双单倍体（DH）群体和包含287个分子标记的遗传图谱，运用复合区间作图法对叶长、无柄叶长、有柄叶长、叶宽、叶柄长、叶柄宽6个叶部形态学性状进行QTL定位及遗传效应的分析。结果表明：在4个连锁群上共检测到12个QTL，分别为叶长相关的3个，无柄叶长相关的2个，有柄叶长相关的2个，叶宽相关的1个，叶柄长相关的2个，叶柄宽相关的2个。各位点的遗传贡献率介于7.5 %~18.9 %之间。其中，叶长与叶柄长的QTL存在共定位，叶宽与叶柄宽的QTL也存在共定位。     

Hapseeker:一个分析单倍型的C++程序(英文)

The C++ program: Hapseeker was developed to analyze DNA or RNA sequence, besides, Hapseeker could be used to identify haplotype, calculate frequency of each haplotype as well as find variable site quickly. Moreover, Hapseeker had many advantages such as simple operation, rapid running speed and high accuracy.     

禽流感病0毒血凝素保守氨基酸对其受体结合位点的影响

采用PCR定点突变技术,对H5N1亚型禽流感病毒的血凝素HA基因受体结合位点相关的保守氨基酸分别进行以下位点的定点突变:35位K→R、45位D→N、98位Y→F、193位K→R和267位A→T,构建突变表达载体pCI-HA,转染293T细胞进行瞬时表达.流式细胞检测结果显示:193位K→R的突变体的HA的表达显著增加;98位Y→F突变体的HA的表达受到显著抑制.同时,血球吸附试验表明,同→HA突变体吸附鸡红细胞和马红细胞时,显示出不同的红细胞吸附能力.因此,受体结合位点相关的193位和98位的保守氨基酸不仅对受体结合位点结构域的形成有影响,它们还在决定AIV感染的宿主特异性中具有重要的作用.     

俄罗斯小麦蚜虫抗性基因的分子图谱和等位基因关系

俄罗斯小麦蚜虫（RWA）是一种世界性的小麦害虫。虽然应用抗虫小麦能很好地防治俄罗斯小麦蚜虫，但是继续利用蚜虫抗性基因的关键是开展遗传鉴定工作。本研究旨在弄清俄罗斯小麦蚜虫抗性基因Dn1、Dn2、Dn4、Dn5、Dn6、Dnx和几个未鉴定Dn基因的染色体位点和遗传关系。